MINERÍA la mejor puerta de acceso al sector minero MINERÍA / AGOSTO 2022 / EDICIÓN 539 14 reforestación de sitios afectados, luego de que la explotación minera ha cesado operaciones. Materiales y métodos Descripción de las zonas mineras objeto de análisis El primer estudio ejemplo (E1) (Qiusheng et al., 2021), está referido a una mina de cobre en China y trata sobre los efectos causados por un sistema de tratamiento alcalino pasivo de los drenajes ácidos de dicha unidad de cobre, con 20 años de operación, la cual vierte efluentes alcalinizados sobre el río Jinsha, en la provincia de Yunnan, en el suroeste chino (26°17.51'– 26°17.59' N, 102°22.94'–102°23.17' E). El problema causado por el vertido de las aguas residuales de la mina al río es un incremento en la concentración de azufre (S, 84.06 g/kg), cobre (Cu, 1.63 g/kg) y otros elementos metálicos (Zn, Cr), aumentando la alcalinidad del río. En dicho estudio se recogieron un total de 36 muestras en cuatro zonas diferentes: en la poza de sedimentación (poza contaminada), en el canal efluente a la poza (canal contaminado) y aguas río arriba (antes de la poza y no contaminadas) y aguas río abajo (después de la poza y contaminadas) durante mayo de 2017. Las especificaciones y características geoquímicas de estas muestras pueden consultarse en el artículo referido (Qiusheng et al., 2021). El segundo estudio ejemplo (E2) (Ezeokoli et al., 2020), trata sobre el cierre de minas de carbón en Sudáfrica. Este compara las poblaciones bacterianas del terreno rehabilitado de tres minas (“reclamation sites”), con respecto a las zonas de las tierras vírgenes adyacentes a cada una de ellas (“reference sites”), además de tener en cuenta que cada una de estas minas fueron rehabilitadas (reclamadas) en diferentes momentos en el tiempo. Las tres minas se sitúan en la provincia sudafricana de Mpumalanga (29° 3' 36'' S, 25° 52' 12'' E) y fueron denominadas como X, Y y Z. En dicho estudio, se muestrearon seis localizaciones durante los meses de abril-mayo de 2016, recogiendo un total de 66 muestras. Las especificaciones y características geoquímicas de estas pueden consultarse en el artículo referido (Ezeokoli, 2020). Fuente de datos metagenómicos Los datos metagenómicos han sido obtenidos del Archivo Europeo de Nucleótidos (ENA, European Nucleotide Archive) (Rasko, 2011). Los datos ómicos concernientes a la mina China (E1) están disponibles en el ID de estudio PRJNA544886. Son un total de 36 muestras secuenciadas mediante la tecnología de Illumina Hi-seq paired-end para el amplicón 16S (V4), con una media de 64,523 (desviación estándar: ± 13,632) lecturas crudas por muestra. Las especificaciones de la secuenciación se pueden consultar en el artículo de Qiusheng de 2021. Los datos concernientes a las minas sudafricanas (E2) están disponibles en el estudio PRJNA526293. Son un total de 88 muestras secuenciadas mediante la tecnología de Illumina Miseq paired-end para el amplicón 16S (V3V4), con una media de 98,802 (± 123,154) lecturas crudas por muestra. Las especificaciones de la secuenciación se pueden consultar en el artículo de Ezeokoli de 2020. Análisis bioinformático de amplicones A partir de los datos crudos de secuenciación del amplicón 16S, se realizó el procesamiento bioinformático, por separado, para cada uno de ellos, efectuando antes un control de calidad de las secuencias mediante FastQC (Andrews, 2010), realizando los sumarios con MultiQC (Ewels et al., 2016). Para eliminar las secuencias y regiones de baja calidad, se usó el programa Fastp (Chen et al. 2018). A continuación, se ejecutó el análisis de las secuencias depuradas mediante la suite Usearch v11.1 (Edgar, 2010). A partir de las secuencias totales se procedió a su agrupación o clusterización con el objetivo de determinar qué ZOTUs, zero-radius Operative Taxonomical Units (Callahan, 2017; Edgar,
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