MINERÍA la mejor puerta de acceso al sector minero MINERÍA / AGOSTO 2022 / EDICIÓN 539 18 el NMDS o ajuste no-métrico multidimensional (Non-Metric Multidimensional Scaling) (Kruskal, 1964). Programas estadísticos Para el tratamiento, depuración y estimación de la métricas de calidad, los índices de diversidad alfa y beta, así como la representación de la abundancia observada a los diferentes niveles taxonómicos, se utilizó el software estadístico R (R Core Team, 2019) y los paquetes estadísticos Vegan (Dixon, 2003) y Phyloseq (McMurdie & Holmes, 2013). Resultados y análisis A diferencia de los artículos originales (Qiusheng et al., 2021 y Ezeokoli et al., 2020) en el que se describe que la unidad de trabajo taxonómica fue el OTU (Operational Taxonomic Unit), cuyo punto de corte se establece en 97% de similitud, en estos reanálisis, en cambio, se utilizó el ZOTUs (Zero-radius Operational Taxonomic Unit), cuyo punto de corte se establece en 99% de similitud, corrigiendo los errores de secuenciación mediante diferentes enfoques de eliminación de ruido o denoising, siendo estas unidades taxonómicas más precisas que las originales para determinar la composición microbiana de las muestras basadas en el amplicón 16S. Análisis de la microbiota de los efluentes tratados de una mina de cobre sobre el río Jinsha (China) Para el ejemplo E1, se obtuvieron 1’756,938 lecturas totales para el conjunto de las 36 muestras secuenciadas y un total de 1,310 ZOTUs identificados una vez filtradas las secuencias, siendo el número de medio de ZOTUs por muestra de 754 (± 203) unidades taxonómicas. El índice de Good Coverage fue del 99.6%, confirmando una buena secuenciación de las muestras. El porcentaje de identificación taxonómica alcanzado a nivel de género fue del 81.1%, es Figura 5. Abundancia relativa observada (%) de los filos bacterianos de muestras de sedimentos de la mina de carbón de la región de Mpumalanga (Sudáfrica). Cada barra vertical representa una muestra (N=66) y están agrupadas bajo los cuatro periodos temporales. Se presentan los filos más abundantes en todas las muestras y los taxones con una abundancia global inferior al 1% conforman una sola categoría nombrada como “Otros” (en gris). No se incluye los taxones no informativos.
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