MINERÍA la mejor puerta de acceso al sector minero MINERÍA / SEPTIEMBRE 2023 / EDICIÓN 552 106 disimilitud filogenético UniFrac Ponderado. Con la matriz de distancias, se realizó la prueba de Permanova, llevándose a cabo 999 permutaciones y corrección por comparaciones múltiples mediante FDR (p<0,05). Asimismo, se comprobó la homocedasticidad de las varianzas de manera multivariante y, una vez obtenida la matriz de distancias, se aplicó el método de ordenación denominado análisis de coordenadas principales o PCoA. Los grupos fueron homogéneos (p=0.340), sin embargo, no se detectaron diferencias entre las comunidades microbianas de las cuatro condiciones evaluadas (p=0.550), como se corrobora en la Figura 2, donde se muestra la disposición de las muestras en el sistema de ordenación PCoA (Figura 4), no se observan grupos de muestras en función de sus características. Como se puede comprobar las muestras SC se encuentran alejadas entre sí mostrando que tienen perfiles microbianos diversos, en cuanto a las muestras de agua (AC y ANC), excepto un duplicado, se encuentran agrupadas, pero junto con muestras de suelo no contaminado (SNC). El máximo de variabilidad explicada fue del 60%. Aunque la variabilidad explicada por las dos primeras componentes fue alta, esto no genera agrupaciones de muestras claras. En conclusión, la riqueza que se obtiene es esperable para este tipo de ecosistemas, caracterizados por no tener muchas especies diferentes, se esperaría que en las muestras no contaminadas fuera mayor ya que en principio, son muestras “naturales”, sin embargo, este no es el caso, hay una falta de riqueza excepto para la muestra SNC1-2, que, en este contexto, se podría considerar como un outlier. Igual pasa con la diversidad, al no observarse diferencias entre condiciones y asociar alguno de estos índices a una condición en particular y poder utilizarlos como indicadores ecológicos. El mismo resultado ha arrojado el estudio de la biodiversidad mediante el índice de UniFrac Ponderado, descartando que las categorías presenten un perfil microbiano lo suficientemente diferencial. Un aspecto importante en el análisis de la microbiota es el estudio de la composición microbiana, es decir, qué taxones y con qué frecuencia se hallan presentes en las muestras (Lin & Peddada, 2020). Para ello, se trabajó con dos tipos de abundancias: la abundancia absoluta observada o recuento (n) y la abundancia relativa observada o proporción (%). La abundancia absoluta se calculó teniendo en cuenta el recuento de las lecturas por cada taxón detectado a los diferentes niveles taxonómicos evaluados. Este recuento se obtiene sumando las lecturas de los ZOTU que pertenezcan al mismo taxón. La abundancia relativa se obtuvo estimando las proporciones de cada taxón, esto es, dividiendo el recuento obtenido por cada taxón por muestra por el recuento total de lecturas en dicha muestra. Para el cómputo total de lecturas por muestra, se excluyeron de su cálculo aquellos taxones sin taxonomía informativa, esto es, las proporciones estimadas fueron las proporciones válidas. La Figura 6. Abundancia relativa observada (%) de las familias de procariotas. Cada barra vertical representa una muestra (N=13). Se presentan las familias más abundantes en todas las muestras y los taxones con una abundancia global inferior al 1% fueron colapsados en una sola categoría nombrada como “Otros” (en gris). Figure 6. Observed relative abundance (%) of prokaryote families. Each vertical bar represents one sample (N = 13). The most abundant families in all samples are shown and taxa with an overall abundance of less than 1% were collapsed into a single category named "Other" (in gray). obtained is to be expected for this type of ecosystems, characterized by not having many different species, it would be expected that in the uncontaminated samples it would be higher since, in principle, they are "natural" samples, however, this is not the case, there is a lack of richness except for sample SNC1-2, which, in this context, could be considered as an outlier. The same happens with diversity, since no differences between conditions are observed and some of these indices are associated to a particular condition and can be used as ecological indicators. The same result was obtained from the study of biodiversity using the Weighted UniFrac index, ruling out the possibility that the categories present a sufficiently differential microbial profile. An important aspect of microbiota analysis is the study of microbial composition, i.e., which taxa and how often they are present in the samples (Lin & Peddada, 2020). For this purpose, we worked with two types of abundances: the absolute observed abundance or count (n) and the relative observed abundance or proportion (%). The absolute abundance observed was calculated by taking into account the count of readings for each taxon detected at the different taxonomic levels evaluated. This count is obtained by summing the readings of ZOTU belonging to the same taxon. The relative abundance observed was obtained by estimating the proportions of each taxon, that is, by dividing the count obtained for each taxon per
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